Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed4Q80WQ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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