Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ8

Mis18bp1, Mis18-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18bp1Q80WQ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mis18bp1Q80WQ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mis18bp1Q80WQ8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms