Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnupnQ80W37 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms