Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms