Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf6Q80UQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rassf6Q80UQ2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms