Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rhox8Q6VSS7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms