Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms