Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms