Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6P7

Parp6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp6Q6P6P7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp6Q6P6P7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp6Q6P6P7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms