Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep135Q6P5D4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Cep135Q6P5D4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep135Q6P5D4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms