Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms