Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx4Q6P1D7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms