Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Soga3Q6NZL0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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