Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RragbQ6NTA4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RragbQ6NTA4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms