Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms