Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms