Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd5Q68ED3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Papd5Q68ED3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms