Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Frem1Q684R7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Frem1Q684R7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms