Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4eQ66X19 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms