Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20865Q62460 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms