Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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Hoxa13Q62424 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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