Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms