Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itm2aQ61500 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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