Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms