Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JrkQ60976 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms