Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms