Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf3Q60765 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms