Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mkrn3Q60764 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms