Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms