Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms