Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms