Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms