Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms