Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce1lQ5D525 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms