Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms