Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt35Q497I4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms