Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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