Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms