Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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