Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms