Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zmat1Q3V0C1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms