Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933416C03RikQ3V063 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933416C03RikQ3V063 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms