Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms