Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms