Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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