Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef40Q3UPH7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef40Q3UPH7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms