Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms