Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrch2Q3UMG5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms