Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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