Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sec24aQ3U2P1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec24aQ3U2P1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms